>>20 さん[クリスタルでセーブができない]
最新バージョンで確認しましたところ、セーブされ報告の現象を再現できませんでした。
現在可能性として気になるのは、セーブデータ異常となり以下のセーブ手順のいずれかが実施できない状況となっていることです。

セーブ手順
[1]クリスタルに接触
[2]画面左下に select to save の文字が表示される
[3]選択ボタンを押下
[4]星のエフェクトが出る
[5]体力が回復する
[6]データセーブ

大変お手数ですが、上記手順にてどの部分まで実行できたかご連絡いただけないでしょうか。
例えば、[2]の文字が出ていない可能性もあります。

ご確認の程、宜しくお願い致します。
宜しくお願い致します。